Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXF1Q12946 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXF1Q12946 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXF1Q12946 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXF1Q12946 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXF1Q12946 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXF1Q12946 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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