Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX10Q12887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX10Q12887 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX10Q12887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX10Q12887 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX10Q12887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX10Q12887 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX10Q12887 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX10Q12887 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COX10Q12887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX10Q12887 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COX10Q12887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX10Q12887 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COX10Q12887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX10Q12887 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX10Q12887 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX10Q12887 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX10Q12887 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX10Q12887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX10Q12887 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX10Q12887 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX10Q12887 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX10Q12887 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX10Q12887 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX10Q12887 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX10Q12887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX10Q12887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX10Q12887 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX10Q12887 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX10Q12887 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX10Q12887 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX10Q12887 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX10Q12887 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX10Q12887 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX10Q12887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX10Q12887 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX10Q12887 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX10Q12887 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX10Q12887 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX10Q12887 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX10Q12887 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX10Q12887 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX10Q12887 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX10Q12887 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX10Q12887 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX10Q12887 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX10Q12887 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX10Q12887 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX10Q12887 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX10Q12887 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX10Q12887 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX10Q12887 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX10Q12887 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX10Q12887 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX10Q12887 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX10Q12887 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX10Q12887 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX10Q12887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX10Q12887 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX10Q12887 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX10Q12887 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX10Q12887 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX10Q12887 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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