Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNMA1Q12791 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNMA1Q12791 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNMA1Q12791 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNMA1Q12791 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNMA1Q12791 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNMA1Q12791 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNMA1Q12791 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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