Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIF1AQ12756 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIF1AQ12756 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
KIF1AQ12756 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIF1AQ12756 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
KIF1AQ12756 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KIF1AQ12756 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KIF1AQ12756 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KIF1AQ12756 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KIF1AQ12756 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KIF1AQ12756 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KIF1AQ12756 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIF1AQ12756 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms