Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 PRY1YJL079C 900 nt9.23□□□□□ -0.93
SMF3Q12078 BRR1YPR057W 1026 nt9.23□□□□□ -0.93
SMF3Q12078 LEU9YOR108W 1815 nt9.22□□□□□ -0.93
SMF3Q12078 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.22□□□□□ -0.93
SMF3Q12078 TOA2YKL058W 369 nt9.21□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 YMR103CYMR103C 363 nt9.21□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 STE4YOR212W 1272 nt9.21□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 MEP3YPR138C 1470 nt9.21□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 DTR1YBR180W 1719 nt9.19□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 RIB2YOL066C 1776 nt9.19□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 SHY1YGR112W 1170 nt9.18□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 YLR349WYLR349W 507 nt9.18□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 YGL114WYGL114W 2178 nt9.17□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 HXT12YIL170W 1374 nt9.15□□□□□ -0.94
SMF3Q12078 GND2YGR256W 1479 nt9.15□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 MUP1YGR055W 1725 nt9.14□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 VRG4YGL225W 1014 nt9.14□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 UFO1YML088W 2007 nt9.14□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 ILV2YMR108W 2064 nt9.13□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 YJL055WYJL055W 738 nt9.13□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 CSM1YCR086W 573 nt9.12□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 YEL008WYEL008W 381 nt9.12□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.12□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 ZRT3YKL175W 1512 nt9.11□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 ADH7YCR105W 1086 nt9.09□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 RFC1YOR217W 2586 nt9.09□□□□□ -0.95
SMF3Q12078 URA6YKL024C 615 nt9.08□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 GPN2YOR262W 1044 nt9.08□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 RSC4YKR008W 1878 nt9.07□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 BNI5YNL166C 1347 nt9.06□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 PAU15YIR041W 375 nt9.06□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 OYE3YPL171C 1203 nt9.06□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 HOL1YNR055C 1761 nt9.05□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 NPP1YCR026C 2229 nt9.05□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 SAM2YDR502C 1155 nt9.04□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 PHO23YNL097C 993 nt9.04□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 LSB5YCL034W 1065 nt9.04□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 YJL118WYJL118W 660 nt9.03□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 NUC1YJL208C 990 nt9.03□□□□□ -0.96
SMF3Q12078 MAE1YKL029C 2010 nt9.02□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 MSC1YML128C 1542 nt9.02□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 CPD1YGR247W 720 nt9.02□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 YJL067WYJL067W 351 nt9.02□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 SEC61YLR378C 1443 nt9.02□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 SAM3YPL274W 1764 nt9.01□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 PET8YNL003C 855 nt9.01□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 RPT5YOR117W 1305 nt9.01□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 OXA1YER154W 1209 nt8.99□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 GAL3YDR009W 1563 nt8.98□□□□□ -0.97
SMF3Q12078 FLR1YBR008C 1647 nt8.96□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 FUB1YCR076C 753 nt8.96□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 CCT5YJR064W 1689 nt8.96□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 MET2YNL277W 1461 nt8.96□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 YER188WYER188W 720 nt8.95□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 YNL024CYNL024C 741 nt8.95□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 RAS2YNL098C 969 nt8.94□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 RIB7YBR153W 735 nt8.94□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 DLD2YDL178W 1593 nt8.94□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 ILV3YJR016C 1758 nt8.93□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 YDR306CYDR306C 1437 nt8.92□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 RSC8YFR037C 1674 nt8.91□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 FMS1YMR020W 1527 nt8.91□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 TPS1YBR126C 1488 nt8.91□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 SFP1YLR403W 2052 nt8.91□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 YPS3YLR121C 1527 nt8.9□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 OYE2YHR179W 1203 nt8.9□□□□□ -0.98
SMF3Q12078 CWC15YDR163W 528 nt8.88□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.88□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 ESS1YJR017C 513 nt8.88□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 SNZ1YMR096W 894 nt8.88□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 SPP2YOR148C 558 nt8.88□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 EAF3YPR023C 1206 nt8.88□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 HIS2YFR025C 1008 nt8.87□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 ACO2YJL200C 2370 nt8.87□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 THI72YOR192C 1800 nt8.87□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 YMR209CYMR209C 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 YOR325WYOR325W 474 nt8.86□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 OSH7YHR001W 1314 nt8.85□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 HEM13YDR044W 987 nt8.85□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.85□□□□□ -0.99
SMF3Q12078 ACH1YBL015W 1581 nt8.83□□□□□ -1
SMF3Q12078 COQ8YGL119W 1506 nt8.81□□□□□ -1
SMF3Q12078 SOL2YCR073W-A 948 nt8.81□□□□□ -1
SMF3Q12078 PAU5YFL020C 369 nt8.81□□□□□ -1
SMF3Q12078 TAF13YML098W 504 nt8.81□□□□□ -1
SMF3Q12078 PGC1YPL206C 966 nt8.81□□□□□ -1
SMF3Q12078 YPR126CYPR126C 309 nt8.81□□□□□ -1
SMF3Q12078 DDI1YER143W 1287 nt8.8□□□□□ -1
SMF3Q12078 TMA23YMR269W 636 nt8.8□□□□□ -1
SMF3Q12078 DAK2YFL053W 1776 nt8.8□□□□□ -1
SMF3Q12078 GAL2YLR081W 1725 nt8.8□□□□□ -1
SMF3Q12078 TAT2YOL020W 1779 nt8.78□□□□□ -1
SMF3Q12078 LSM5YER146W 282 nt8.78□□□□□ -1
SMF3Q12078 UGP1YKL035W 1500 nt8.78□□□□□ -1
SMF3Q12078 CTI6YPL181W 1521 nt8.77□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 OPI10YOL032W 741 nt8.77□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 VPS62YGR141W 1404 nt8.77□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 GNP1YDR508C 1992 nt8.77□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 GTB1YDR221W 2109 nt8.76□□□□□ -1.01
SMF3Q12078 YMR262WYMR262W 942 nt8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.5 ms