Protein–RNA interactions for Protein: Q09FC8

ZNF415, Zinc finger protein 415, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF415Q09FC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF415Q09FC8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF415Q09FC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF415Q09FC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF415Q09FC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF415Q09FC8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF415Q09FC8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF415Q09FC8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF415Q09FC8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF415Q09FC8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF415Q09FC8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF415Q09FC8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF415Q09FC8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF415Q09FC8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF415Q09FC8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF415Q09FC8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms