Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSM1Q08AH1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSM1Q08AH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSM1Q08AH1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSM1Q08AH1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSM1Q08AH1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSM1Q08AH1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms