Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PDE4DQ08499 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDE4DQ08499 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4DQ08499 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4DQ08499 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4DQ08499 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDE4DQ08499 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms