Protein–RNA interactions for Protein: Q08387

DNL4, DNA ligase 4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNL4Q08387 HXT1YHR094C 1713 nt9.88□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 DBP1YPL119C 1854 nt9.88□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 ALD4YOR374W 1560 nt9.88□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 GID7YCL039W 2238 nt9.87□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 MEP3YPR138C 1470 nt9.86□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 YJL055WYJL055W 738 nt9.86□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 YBL086CYBL086C 1401 nt9.86□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 BRR1YPR057W 1026 nt9.85□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 RIM8YGL045W 1629 nt9.84□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 TOA2YKL058W 369 nt9.83□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 LEU9YOR108W 1815 nt9.82□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 MAE1YKL029C 2010 nt9.82□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 YMR103CYMR103C 363 nt9.82□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 LSB5YCL034W 1065 nt9.81□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 CSM1YCR086W 573 nt9.8□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 HIF1YLL022C 1158 nt9.79□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 CCT5YJR064W 1689 nt9.78□□□□□ -0.84
DNL4Q08387 NUC1YJL208C 990 nt9.77□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 NAP1YKR048C 1254 nt9.77□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 SEN2YLR105C 1134 nt9.77□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 PAU5YFL020C 369 nt9.75□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 TPO4YOR273C 1980 nt9.74□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.74□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 YJL118WYJL118W 660 nt9.74□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 PGC1YPL206C 966 nt9.74□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 GND2YGR256W 1479 nt9.73□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 RIB7YBR153W 735 nt9.72□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 RPT5YOR117W 1305 nt9.72□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 HMG2YLR450W 3138 nt9.72□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 GAL3YDR009W 1563 nt9.71□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 THI72YOR192C 1800 nt9.71□□□□□ -0.85
DNL4Q08387 SAM2YDR502C 1155 nt9.71□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 STP3YLR375W 1032 nt9.71□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 TAF13YML098W 504 nt9.71□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 PHO23YNL097C 993 nt9.71□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 SHY1YGR112W 1170 nt9.7□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 YBR232CYBR232C 360 nt9.7□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 BNI5YNL166C 1347 nt9.7□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 UFO1YML088W 2007 nt9.68□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 PUP1YOR157C 786 nt9.67□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 SAM3YPL274W 1764 nt9.66□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 MSC1YML128C 1542 nt9.66□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 YGL114WYGL114W 2178 nt9.65□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 SEC61YLR378C 1443 nt9.65□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 SPT20YOL148C 1815 nt9.65□□□□□ -0.86
DNL4Q08387 URA6YKL024C 615 nt9.64□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 OXA1YER154W 1209 nt9.63□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 OYE3YPL171C 1203 nt9.63□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 YER188WYER188W 720 nt9.6□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 YJL064WYJL064W 396 nt9.6□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 ZRT3YKL175W 1512 nt9.6□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 SNZ1YMR096W 894 nt9.59□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 PET8YNL003C 855 nt9.59□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 URA8YJR103W 1737 nt9.59□□□□□ -0.87
DNL4Q08387 OYE2YHR179W 1203 nt9.58□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 YMR262WYMR262W 942 nt9.58□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 RAS2YNL098C 969 nt9.58□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 TPS1YBR126C 1488 nt9.58□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 ACO2YJL200C 2370 nt9.58□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 PAU19YMR325W 375 nt9.57□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 MHF1YOL086W-A 273 nt9.56□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 FUB1YCR076C 753 nt9.55□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 YPR126CYPR126C 309 nt9.55□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 PAR32YDL173W 888 nt9.54□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 POT1YIL160C 1254 nt9.54□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 GSF2YML048W 1212 nt9.54□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 ESBP6YNL125C 2022 nt9.54□□□□□ -0.88
DNL4Q08387 EAF3YPR023C 1206 nt9.52□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 CTI6YPL181W 1521 nt9.51□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 DAK2YFL053W 1776 nt9.51□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 DLD2YDL178W 1593 nt9.5□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 IML3YBR107C 738 nt9.5□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 TIM44YIL022W 1296 nt9.49□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 YNL024CYNL024C 741 nt9.48□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 OSH7YHR001W 1314 nt9.48□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 MUP1YGR055W 1725 nt9.48□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 TUB4YLR212C 1422 nt9.48□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 FLR1YBR008C 1647 nt9.47□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 RSC8YFR037C 1674 nt9.47□□□□□ -0.89
DNL4Q08387 GTB1YDR221W 2109 nt9.46□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 ILV2YMR108W 2064 nt9.45□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 TMA23YMR269W 636 nt9.45□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 SLG1YOR008C 1137 nt9.45□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 YJL067WYJL067W 351 nt9.44□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 RPC82YPR190C 1965 nt9.44□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 YPS3YLR121C 1527 nt9.43□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 APS2YJR058C 444 nt9.43□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 DDI1YER143W 1287 nt9.42□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 FMS1YMR020W 1527 nt9.41□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 LSM5YER146W 282 nt9.41□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 TIP1YBR067C 633 nt9.41□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 SOL2YCR073W-A 948 nt9.4□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 CWC15YDR163W 528 nt9.4□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 SPP2YOR148C 558 nt9.4□□□□□ -0.9
DNL4Q08387 NIF3YGL221C 867 nt9.38□□□□□ -0.91
DNL4Q08387 IMO32YGR031W 1029 nt9.38□□□□□ -0.91
DNL4Q08387 DTR1YBR180W 1719 nt9.38□□□□□ -0.91
DNL4Q08387 INA1YLR413W 2028 nt9.36□□□□□ -0.91
DNL4Q08387 HEM13YDR044W 987 nt9.35□□□□□ -0.91
DNL4Q08387 GAL2YLR081W 1725 nt9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.7 ms