Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX8Q06710 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX8Q06710 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX8Q06710 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAX8Q06710 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX8Q06710 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms