Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN11Q06124 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN11Q06124 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN11Q06124 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPN11Q06124 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN11Q06124 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN11Q06124 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN11Q06124 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN11Q06124 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms