Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC63Q05C16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC63Q05C16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC63Q05C16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC63Q05C16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC63Q05C16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRC63Q05C16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC63Q05C16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms