Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PTK2Q05397 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK2Q05397 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTK2Q05397 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTK2Q05397 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK2Q05397 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTK2Q05397 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTK2Q05397 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTK2Q05397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms