Protein–RNA interactions for Protein: Q05022

RRP5, rRNA biogenesis protein RRP5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP5Q05022 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.16□□□□□ -0.46
RRP5Q05022 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.16□□□□□ -0.46
RRP5Q05022 GSF2YML048W 1212 nt12.12□□□□□ -0.47
RRP5Q05022 YPL251WYPL251W 303 nt12.12□□□□□ -0.47
RRP5Q05022 APS2YJR058C 444 nt12.11□□□□□ -0.47
RRP5Q05022 CSM1YCR086W 573 nt12.08□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 TUB4YLR212C 1422 nt12.08□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 YBL086CYBL086C 1401 nt12.06□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 MHF1YOL086W-A 273 nt12.06□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 NUC1YJL208C 990 nt12.05□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 LIP1YMR298W 453 nt12.05□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 YCP4YCR004C 744 nt12.04□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 SAM3YPL274W 1764 nt12.03□□□□□ -0.48
RRP5Q05022 SAM35YHR083W 990 nt12.02□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 BMT6YLR063W 1098 nt12.01□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 CDD1YLR245C 429 nt11.99□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 YPR126CYPR126C 309 nt11.99□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 KRE1YNL322C 942 nt11.98□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 RIB7YBR153W 735 nt11.97□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 DPS1YLL018C 1674 nt11.97□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 SNF1YDR477W 1902 nt11.96□□□□□ -0.49
RRP5Q05022 BOR1YNL275W 1731 nt11.96□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 BNI5YNL166C 1347 nt11.96□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 SSN3YPL042C 1668 nt11.95□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 DBP1YPL119C 1854 nt11.95□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 POT1YIL160C 1254 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 IRC24YIR036C 792 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 YCR025CYCR025C 411 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 YMR103CYMR103C 363 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 ACO2YJL200C 2370 nt11.92□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 PHO23YNL097C 993 nt11.91□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 CTI6YPL181W 1521 nt11.91□□□□□ -0.5
RRP5Q05022 RPT5YOR117W 1305 nt11.89□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 PRP4YPR178W 1398 nt11.89□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 TOA2YKL058W 369 nt11.89□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 BUD20YLR074C 501 nt11.89□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 HXT1YHR094C 1713 nt11.88□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 GND2YGR256W 1479 nt11.86□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 SAM50YNL026W 1455 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.84□□□□□ -0.51
RRP5Q05022 HIF1YLL022C 1158 nt11.83□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 NIF3YGL221C 867 nt11.82□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 BRR1YPR057W 1026 nt11.82□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 LYS20YDL182W 1287 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 OYE2YHR179W 1203 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 DAK2YFL053W 1776 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 TPS1YBR126C 1488 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 NAS2YIL007C 663 nt11.79□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 UFO1YML088W 2007 nt11.78□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 IGD1YFR017C 588 nt11.78□□□□□ -0.52
RRP5Q05022 LEU9YOR108W 1815 nt11.76□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 SWM1YDR260C 513 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 MSC1YML128C 1542 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 SAM2YDR502C 1155 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 DDI1YER143W 1287 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 BIO5YNR056C 1686 nt11.73□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 SHY1YGR112W 1170 nt11.72□□□□□ -0.53
RRP5Q05022 FLX1YIL134W 936 nt11.69□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 IPL1YPL209C 1104 nt11.69□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 OYE3YPL171C 1203 nt11.69□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 IML3YBR107C 738 nt11.68□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 SEC61YLR378C 1443 nt11.67□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 YNL024CYNL024C 741 nt11.67□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 MCH5YOR306C 1566 nt11.67□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 YMR007WYMR007W 381 nt11.66□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 FLR1YBR008C 1647 nt11.65□□□□□ -0.54
RRP5Q05022 FUB1YCR076C 753 nt11.64□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 RAS2YNL098C 969 nt11.64□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 RPL12BYDR418W 498 nt11.63□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 EAF3YPR023C 1206 nt11.63□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 YER188WYER188W 720 nt11.62□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 TMA23YMR269W 636 nt11.61□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 SPE2YOL052C 1191 nt11.61□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 MFG1YDL233W 1377 nt11.61□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 SPS100YHR139C 981 nt11.6□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 YOR343CYOR343C 327 nt11.6□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 HOG1YLR113W 1308 nt11.6□□□□□ -0.55
RRP5Q05022 GRH1YDR517W 1119 nt11.58□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 PAU21YOR394W 495 nt11.58□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 PAU22YPL282C 495 nt11.58□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 TGA1tA(UGC)A 73 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 ADE8YDR408C 645 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 PHB2YGR231C 933 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 FCY1YPR062W 477 nt11.56□□□□□ -0.56
RRP5Q05022 ABZ2YMR289W 1125 nt11.55□□□□□ -0.56
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