Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMX1Q04741 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX1Q04741 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMX1Q04741 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMX1Q04741 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMX1Q04741 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX1Q04741 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms