Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID5AQ03989 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID5AQ03989 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID5AQ03989 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID5AQ03989 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID5AQ03989 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARID5AQ03989 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID5AQ03989 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID5AQ03989 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms