Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
ERCC6Q03468 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
ERCC6Q03468 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ERCC6Q03468 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
ERCC6Q03468 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
ERCC6Q03468 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
ERCC6Q03468 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
ERCC6Q03468 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
ERCC6Q03468 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ERCC6Q03468 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
ERCC6Q03468 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC47.58■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
ERCC6Q03468 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC47.51■■■■■ 5.2
ERCC6Q03468 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC47.5■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ERCC6Q03468 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC47.44■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
ERCC6Q03468 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
ERCC6Q03468 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC47.29■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
ERCC6Q03468 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
ERCC6Q03468 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
ERCC6Q03468 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
ERCC6Q03468 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
ERCC6Q03468 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
ERCC6Q03468 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC47.19■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC47.15■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ERCC6Q03468 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
ERCC6Q03468 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
ERCC6Q03468 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC47.08■■■■■ 5.13
ERCC6Q03468 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms