Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROM1Q03395 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROM1Q03395 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROM1Q03395 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ROM1Q03395 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROM1Q03395 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROM1Q03395 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ROM1Q03395 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROM1Q03395 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROM1Q03395 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROM1Q03395 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ROM1Q03395 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROM1Q03395 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms