Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 ADH1YOL086C 1047 nt10.54□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 SAM2YDR502C 1155 nt10.53□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 OYE3YPL171C 1203 nt10.53□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 YJL067WYJL067W 351 nt10.52□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 YNR029CYNR029C 1290 nt10.52□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 FUN14YAL008W 597 nt10.51□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 YLR349WYLR349W 507 nt10.49□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 PET8YNL003C 855 nt10.49□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 Q0010Q0010 387 nt10.49□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 RIB2YOL066C 1776 nt10.48□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 VRG4YGL225W 1014 nt10.48□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 CSM1YCR086W 573 nt10.47□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 SEC61YLR378C 1443 nt10.47□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 YJL055WYJL055W 738 nt10.46□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 BNI5YNL166C 1347 nt10.46□□□□□ -0.73
GDE1Q02979 HXT12YIL170W 1374 nt10.46□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 ADH7YCR105W 1086 nt10.45□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 NUC1YJL208C 990 nt10.45□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 LSB5YCL034W 1065 nt10.45□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 YAT1YAR035W 2064 nt10.44□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 NPP1YCR026C 2229 nt10.43□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 PAU15YIR041W 375 nt10.43□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 PHO23YNL097C 993 nt10.43□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 GPN2YOR262W 1044 nt10.43□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 YJR154WYJR154W 1041 nt10.42□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 RFC1YOR217W 2586 nt10.41□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 OXA1YER154W 1209 nt10.41□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 MSC1YML128C 1542 nt10.4□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 CSM2YIL132C 642 nt10.4□□□□□ -0.74
GDE1Q02979 INA1YLR413W 2028 nt10.4□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 CWC15YDR163W 528 nt10.38□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 YER188WYER188W 720 nt10.38□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 RPT5YOR117W 1305 nt10.37□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 YJL118WYJL118W 660 nt10.37□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 YEL008WYEL008W 381 nt10.36□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 DLD2YDL178W 1593 nt10.35□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 RSC8YFR037C 1674 nt10.35□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 FLR1YBR008C 1647 nt10.35□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 RAS2YNL098C 969 nt10.34□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 SFP1YLR403W 2052 nt10.34□□□□□ -0.75
GDE1Q02979 FMS1YMR020W 1527 nt10.33□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 DTR1YBR180W 1719 nt10.33□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 FUB1YCR076C 753 nt10.33□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 SPP2YOR148C 558 nt10.33□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 SAM3YPL274W 1764 nt10.32□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 YPS3YLR121C 1527 nt10.32□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 ILV2YMR108W 2064 nt10.3□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 RIB7YBR153W 735 nt10.3□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 RPC82YPR190C 1965 nt10.3□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 CPD1YGR247W 720 nt10.29□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 GAL3YDR009W 1563 nt10.29□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.29□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.29□□□□□ -0.76
GDE1Q02979 OYE2YHR179W 1203 nt10.27□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 OSH7YHR001W 1314 nt10.27□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 TPS1YBR126C 1488 nt10.26□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 MET2YNL277W 1461 nt10.25□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.24□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 VPS62YGR141W 1404 nt10.24□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 EAF3YPR023C 1206 nt10.23□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 ACH1YBL015W 1581 nt10.22□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 HEM13YDR044W 987 nt10.22□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 CCT5YJR064W 1689 nt10.22□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 SPT20YOL148C 1815 nt10.21□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.21□□□□□ -0.77
GDE1Q02979 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.2□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 HSL7YBR133C 2484 nt10.19□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 HEM14YER014W 1620 nt10.19□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 SOL2YCR073W-A 948 nt10.19□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 CMP2YML057W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 YDL086WYDL086W 822 nt10.16□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 LSM5YER146W 282 nt10.16□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 ESS1YJR017C 513 nt10.16□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 YOR325WYOR325W 474 nt10.16□□□□□ -0.78
GDE1Q02979 ILV3YJR016C 1758 nt10.14□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 DDI1YER143W 1287 nt10.14□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 THI72YOR192C 1800 nt10.14□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 HEL2YDR266C 1920 nt10.13□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 SNZ1YMR096W 894 nt10.13□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 TMA23YMR269W 636 nt10.13□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 TAT2YOL020W 1779 nt10.13□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 CCT2YIL142W 1584 nt10.13□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 YNL024CYNL024C 741 nt10.11□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 OPI10YOL032W 741 nt10.11□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.1□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.1□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.1□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.1□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 DAK2YFL053W 1776 nt10.09□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 TAF13YML098W 504 nt10.09□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 GTB1YDR221W 2109 nt10.09□□□□□ -0.79
GDE1Q02979 YPR126CYPR126C 309 nt10.08□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 YDR455CYDR455C 309 nt10.07□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 PAU5YFL020C 369 nt10.07□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 MUP1YGR055W 1725 nt10.06□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 IMO32YGR031W 1029 nt10.05□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 CTI6YPL181W 1521 nt10.03□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 PAB1YER165W 1734 nt10.03□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 MCM5YLR274W 2328 nt10.03□□□□□ -0.8
GDE1Q02979 IML3YBR107C 738 nt10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.4 ms