Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ROR1Q01973 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ROR1Q01973 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ROR1Q01973 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ROR1Q01973 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ROR1Q01973 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ROR1Q01973 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ROR1Q01973 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ROR1Q01973 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms