Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP1Q01518 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CAP1Q01518 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAP1Q01518 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP1Q01518 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CAP1Q01518 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CAP1Q01518 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAP1Q01518 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CAP1Q01518 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CAP1Q01518 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAP1Q01518 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAP1Q01518 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAP1Q01518 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAP1Q01518 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms