Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MAP3K9P80192 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MAP3K9P80192 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
MAP3K9P80192 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MAP3K9P80192 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MAP3K9P80192 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MAP3K9P80192 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MAP3K9P80192 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms