Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ERVK-24P63145 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERVK-24P63145 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERVK-24P63145 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ERVK-24P63145 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERVK-24P63145 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVK-24P63145 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVK-24P63145 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms