Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG7P62955 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG7P62955 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNG7P62955 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNG7P62955 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms