Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSNL1P62760 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSNL1P62760 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VSNL1P62760 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VSNL1P62760 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSNL1P62760 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSNL1P62760 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSNL1P62760 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSNL1P62760 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSNL1P62760 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSNL1P62760 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VSNL1P62760 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSNL1P62760 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSNL1P62760 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms