Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1CBP62140 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1CBP62140 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CBP62140 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CBP62140 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1CBP62140 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CBP62140 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms