Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO2P61956 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO2P61956 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO2P61956 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUMO2P61956 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SUMO2P61956 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SUMO2P61956 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms