Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRP55822 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRP55822 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BGRP55822 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRP55822 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3BGRP55822 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3BGRP55822 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms