Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSE1LP55060 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSE1LP55060 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSE1LP55060 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSE1LP55060 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSE1LP55060 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSE1LP55060 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSE1LP55060 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSE1LP55060 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSE1LP55060 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms