Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRADP55042 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRADP55042 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRADP55042 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRADP55042 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRADP55042 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRADP55042 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRADP55042 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRADP55042 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRADP55042 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRADP55042 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRADP55042 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRADP55042 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRADP55042 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRADP55042 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRADP55042 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRADP55042 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRADP55042 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRADP55042 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRADP55042 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRADP55042 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRADP55042 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRADP55042 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRADP55042 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRADP55042 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRADP55042 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRADP55042 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRADP55042 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRADP55042 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRADP55042 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRADP55042 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRADP55042 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRADP55042 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRADP55042 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRADP55042 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRADP55042 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRADP55042 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRADP55042 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRADP55042 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRADP55042 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRADP55042 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRADP55042 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RRADP55042 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRADP55042 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRADP55042 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRADP55042 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRADP55042 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRADP55042 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRADP55042 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRADP55042 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRADP55042 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRADP55042 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRADP55042 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RRADP55042 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRADP55042 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRADP55042 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRADP55042 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRADP55042 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRADP55042 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRADP55042 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRADP55042 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRADP55042 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRADP55042 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRADP55042 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRADP55042 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRADP55042 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRADP55042 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRADP55042 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRADP55042 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRADP55042 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRADP55042 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRADP55042 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRADP55042 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRADP55042 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRADP55042 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRADP55042 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRADP55042 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRADP55042 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRADP55042 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRADP55042 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRADP55042 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRADP55042 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRADP55042 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRADP55042 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRADP55042 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRADP55042 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRADP55042 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRADP55042 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRADP55042 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRADP55042 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRADP55042 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRADP55042 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRADP55042 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRADP55042 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms