Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPHA4P54764 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPHA4P54764 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHA4P54764 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHA4P54764 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHA4P54764 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms