Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD23BP54727 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD23BP54727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD23BP54727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD23BP54727 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAD23BP54727 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAD23BP54727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAD23BP54727 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms