Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
APLP1P51693 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
APLP1P51693 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
APLP1P51693 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
APLP1P51693 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
APLP1P51693 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
APLP1P51693 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
APLP1P51693 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
APLP1P51693 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
APLP1P51693 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
APLP1P51693 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
APLP1P51693 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
APLP1P51693 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
APLP1P51693 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
APLP1P51693 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
APLP1P51693 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
APLP1P51693 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
APLP1P51693 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
APLP1P51693 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
APLP1P51693 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
APLP1P51693 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
APLP1P51693 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
APLP1P51693 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
APLP1P51693 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
APLP1P51693 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
APLP1P51693 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
APLP1P51693 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
APLP1P51693 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
APLP1P51693 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
APLP1P51693 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
APLP1P51693 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APLP1P51693 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
APLP1P51693 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APLP1P51693 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
APLP1P51693 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APLP1P51693 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
APLP1P51693 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
APLP1P51693 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
APLP1P51693 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
APLP1P51693 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
APLP1P51693 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
APLP1P51693 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
APLP1P51693 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
APLP1P51693 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
APLP1P51693 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
APLP1P51693 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
APLP1P51693 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
APLP1P51693 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
APLP1P51693 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
APLP1P51693 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
APLP1P51693 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
APLP1P51693 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
APLP1P51693 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
APLP1P51693 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
APLP1P51693 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
APLP1P51693 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
APLP1P51693 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
APLP1P51693 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
APLP1P51693 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
APLP1P51693 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
APLP1P51693 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
APLP1P51693 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
APLP1P51693 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APLP1P51693 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
APLP1P51693 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
APLP1P51693 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP1P51693 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP1P51693 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP1P51693 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APLP1P51693 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
APLP1P51693 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP1P51693 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APLP1P51693 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APLP1P51693 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP1P51693 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP1P51693 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APLP1P51693 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
APLP1P51693 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms