Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP2P50120 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP2P50120 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP2P50120 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBP2P50120 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP2P50120 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBP2P50120 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP2P50120 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBP2P50120 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP2P50120 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBP2P50120 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP2P50120 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP2P50120 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBP2P50120 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP2P50120 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP2P50120 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP2P50120 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP2P50120 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RBP2P50120 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP2P50120 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP2P50120 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP2P50120 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP2P50120 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP2P50120 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP2P50120 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP2P50120 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP2P50120 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP2P50120 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP2P50120 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP2P50120 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP2P50120 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP2P50120 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP2P50120 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP2P50120 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP2P50120 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP2P50120 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP2P50120 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP2P50120 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP2P50120 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP2P50120 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP2P50120 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP2P50120 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP2P50120 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP2P50120 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP2P50120 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP2P50120 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP2P50120 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP2P50120 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP2P50120 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP2P50120 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP2P50120 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP2P50120 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP2P50120 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP2P50120 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP2P50120 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP2P50120 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP2P50120 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP2P50120 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP2P50120 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP2P50120 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP2P50120 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP2P50120 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP2P50120 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP2P50120 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBP2P50120 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP2P50120 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP2P50120 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP2P50120 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBP2P50120 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBP2P50120 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP2P50120 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP2P50120 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP2P50120 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBP2P50120 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP2P50120 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP2P50120 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBP2P50120 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP2P50120 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP2P50120 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP2P50120 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP2P50120 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBP2P50120 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP2P50120 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP2P50120 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBP2P50120 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP2P50120 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBP2P50120 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP2P50120 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP2P50120 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBP2P50120 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP2P50120 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBP2P50120 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBP2P50120 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBP2P50120 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP2P50120 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP2P50120 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP2P50120 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP2P50120 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP2P50120 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP2P50120 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms