Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTDSS1P48651 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTDSS1P48651 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1P48651 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTDSS1P48651 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTDSS1P48651 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTDSS1P48651 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTDSS1P48651 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms