Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX2P48378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX2P48378 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX2P48378 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX2P48378 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX2P48378 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX2P48378 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX2P48378 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX2P48378 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX2P48378 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX2P48378 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX2P48378 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX2P48378 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX2P48378 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX2P48378 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX2P48378 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX2P48378 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX2P48378 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX2P48378 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX2P48378 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX2P48378 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX2P48378 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX2P48378 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX2P48378 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX2P48378 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX2P48378 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX2P48378 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX2P48378 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX2P48378 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX2P48378 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX2P48378 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX2P48378 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX2P48378 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX2P48378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX2P48378 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX2P48378 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX2P48378 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX2P48378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX2P48378 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX2P48378 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX2P48378 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX2P48378 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX2P48378 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX2P48378 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX2P48378 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX2P48378 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX2P48378 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX2P48378 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX2P48378 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX2P48378 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX2P48378 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX2P48378 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX2P48378 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX2P48378 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX2P48378 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX2P48378 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX2P48378 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX2P48378 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX2P48378 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX2P48378 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX2P48378 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX2P48378 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX2P48378 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX2P48378 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX2P48378 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX2P48378 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX2P48378 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX2P48378 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX2P48378 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX2P48378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX2P48378 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX2P48378 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX2P48378 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX2P48378 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX2P48378 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX2P48378 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX2P48378 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX2P48378 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX2P48378 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX2P48378 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX2P48378 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX2P48378 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX2P48378 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX2P48378 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX2P48378 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX2P48378 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX2P48378 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX2P48378 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX2P48378 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX2P48378 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX2P48378 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX2P48378 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX2P48378 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX2P48378 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX2P48378 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX2P48378 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX2P48378 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX2P48378 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX2P48378 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX2P48378 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms