Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA3P43357 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAGEA3P43357 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAGEA3P43357 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAGEA3P43357 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA3P43357 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGEA3P43357 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA3P43357 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms