Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNFP41002 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNFP41002 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNFP41002 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNFP41002 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCNFP41002 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNFP41002 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNFP41002 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNFP41002 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNFP41002 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNFP41002 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNFP41002 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNFP41002 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNFP41002 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNFP41002 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNFP41002 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNFP41002 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNFP41002 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNFP41002 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNFP41002 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNFP41002 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCNFP41002 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNFP41002 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNFP41002 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNFP41002 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNFP41002 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNFP41002 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNFP41002 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCNFP41002 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNFP41002 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNFP41002 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNFP41002 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNFP41002 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNFP41002 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNFP41002 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNFP41002 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNFP41002 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNFP41002 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNFP41002 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNFP41002 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNFP41002 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNFP41002 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNFP41002 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNFP41002 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNFP41002 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNFP41002 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNFP41002 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNFP41002 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNFP41002 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNFP41002 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNFP41002 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNFP41002 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNFP41002 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNFP41002 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNFP41002 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNFP41002 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNFP41002 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNFP41002 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNFP41002 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNFP41002 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNFP41002 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNFP41002 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNFP41002 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNFP41002 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNFP41002 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNFP41002 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNFP41002 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNFP41002 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNFP41002 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNFP41002 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNFP41002 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNFP41002 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNFP41002 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNFP41002 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNFP41002 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNFP41002 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNFP41002 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNFP41002 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNFP41002 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCNFP41002 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCNFP41002 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNFP41002 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNFP41002 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNFP41002 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNFP41002 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNFP41002 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNFP41002 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNFP41002 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNFP41002 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNFP41002 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNFP41002 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNFP41002 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNFP41002 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNFP41002 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNFP41002 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNFP41002 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNFP41002 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNFP41002 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNFP41002 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNFP41002 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms