Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX19P40855 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PEX19P40855 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX19P40855 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX19P40855 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX19P40855 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX19P40855 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX19P40855 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX19P40855 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX19P40855 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX19P40855 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX19P40855 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX19P40855 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX19P40855 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX19P40855 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX19P40855 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX19P40855 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX19P40855 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX19P40855 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX19P40855 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX19P40855 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX19P40855 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX19P40855 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX19P40855 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX19P40855 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX19P40855 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX19P40855 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX19P40855 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX19P40855 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX19P40855 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX19P40855 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX19P40855 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX19P40855 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX19P40855 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX19P40855 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PEX19P40855 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX19P40855 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX19P40855 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX19P40855 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX19P40855 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX19P40855 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX19P40855 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX19P40855 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX19P40855 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX19P40855 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX19P40855 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX19P40855 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX19P40855 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX19P40855 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX19P40855 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX19P40855 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX19P40855 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX19P40855 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX19P40855 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX19P40855 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX19P40855 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX19P40855 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX19P40855 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX19P40855 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX19P40855 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX19P40855 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX19P40855 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX19P40855 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX19P40855 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX19P40855 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX19P40855 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX19P40855 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX19P40855 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX19P40855 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX19P40855 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX19P40855 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX19P40855 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX19P40855 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX19P40855 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX19P40855 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX19P40855 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX19P40855 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX19P40855 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX19P40855 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX19P40855 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX19P40855 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX19P40855 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX19P40855 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX19P40855 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX19P40855 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX19P40855 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX19P40855 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX19P40855 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX19P40855 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX19P40855 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX19P40855 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX19P40855 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX19P40855 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX19P40855 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX19P40855 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX19P40855 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX19P40855 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX19P40855 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX19P40855 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX19P40855 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms