Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP8P40818 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP8P40818 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP8P40818 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP8P40818 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP8P40818 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP8P40818 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP8P40818 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP8P40818 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP8P40818 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP8P40818 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP8P40818 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP8P40818 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP8P40818 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP8P40818 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP8P40818 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP8P40818 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP8P40818 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP8P40818 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP8P40818 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP8P40818 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP8P40818 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP8P40818 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP8P40818 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP8P40818 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP8P40818 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP8P40818 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP8P40818 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP8P40818 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP8P40818 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP8P40818 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP8P40818 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP8P40818 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP8P40818 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP8P40818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP8P40818 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP8P40818 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP8P40818 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP8P40818 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP8P40818 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP8P40818 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP8P40818 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP8P40818 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP8P40818 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP8P40818 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP8P40818 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP8P40818 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP8P40818 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP8P40818 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP8P40818 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP8P40818 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP8P40818 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP8P40818 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP8P40818 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP8P40818 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP8P40818 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP8P40818 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP8P40818 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP8P40818 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP8P40818 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP8P40818 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP8P40818 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP8P40818 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP8P40818 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP8P40818 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP8P40818 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP8P40818 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP8P40818 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP8P40818 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP8P40818 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP8P40818 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP8P40818 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP8P40818 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP8P40818 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP8P40818 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP8P40818 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP8P40818 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP8P40818 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP8P40818 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP8P40818 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP8P40818 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP8P40818 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP8P40818 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP8P40818 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP8P40818 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP8P40818 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP8P40818 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP8P40818 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms