Protein–RNA interactions for Protein: P38324

SLX1, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX1P38324 SAM35YHR083W 990 nt9.86□□□□□ -0.83
SLX1P38324 IRC24YIR036C 792 nt9.86□□□□□ -0.83
SLX1P38324 PAU19YMR325W 375 nt9.86□□□□□ -0.83
SLX1P38324 SLG1YOR008C 1137 nt9.84□□□□□ -0.83
SLX1P38324 LIP1YMR298W 453 nt9.83□□□□□ -0.84
SLX1P38324 TIM44YIL022W 1296 nt9.82□□□□□ -0.84
SLX1P38324 MET2YNL277W 1461 nt9.82□□□□□ -0.84
SLX1P38324 PRM5YIL117C 957 nt9.81□□□□□ -0.84
SLX1P38324 THI72YOR192C 1800 nt9.8□□□□□ -0.84
SLX1P38324 TAF13YML098W 504 nt9.8□□□□□ -0.84
SLX1P38324 CSM1YCR086W 573 nt9.78□□□□□ -0.84
SLX1P38324 YJR114WYJR114W 393 nt9.78□□□□□ -0.84
SLX1P38324 YPL251WYPL251W 303 nt9.78□□□□□ -0.84
SLX1P38324 MEP3YPR138C 1470 nt9.77□□□□□ -0.85
SLX1P38324 YMR103CYMR103C 363 nt9.76□□□□□ -0.85
SLX1P38324 LSB5YCL034W 1065 nt9.76□□□□□ -0.85
SLX1P38324 HEL2YDR266C 1920 nt9.75□□□□□ -0.85
SLX1P38324 YAT1YAR035W 2064 nt9.75□□□□□ -0.85
SLX1P38324 HSL7YBR133C 2484 nt9.74□□□□□ -0.85
SLX1P38324 TIP1YBR067C 633 nt9.74□□□□□ -0.85
SLX1P38324 BRR1YPR057W 1026 nt9.74□□□□□ -0.85
SLX1P38324 GAL3YDR009W 1563 nt9.74□□□□□ -0.85
SLX1P38324 YJL118WYJL118W 660 nt9.73□□□□□ -0.85
SLX1P38324 YMR262WYMR262W 942 nt9.73□□□□□ -0.85
SLX1P38324 NPP1YCR026C 2229 nt9.72□□□□□ -0.85
SLX1P38324 TOA2YKL058W 369 nt9.71□□□□□ -0.86
SLX1P38324 SFP1YLR403W 2052 nt9.71□□□□□ -0.86
SLX1P38324 YBL086CYBL086C 1401 nt9.71□□□□□ -0.86
SLX1P38324 RPT5YOR117W 1305 nt9.7□□□□□ -0.86
SLX1P38324 BSP1YPR171W 1731 nt9.7□□□□□ -0.86
SLX1P38324 RIB1YBL033C 1038 nt9.69□□□□□ -0.86
SLX1P38324 DBP1YPL119C 1854 nt9.69□□□□□ -0.86
SLX1P38324 RIB7YBR153W 735 nt9.69□□□□□ -0.86
SLX1P38324 LEU9YOR108W 1815 nt9.68□□□□□ -0.86
SLX1P38324 HXT1YHR094C 1713 nt9.68□□□□□ -0.86
SLX1P38324 NUC1YJL208C 990 nt9.68□□□□□ -0.86
SLX1P38324 SNZ1YMR096W 894 nt9.68□□□□□ -0.86
SLX1P38324 PAR32YDL173W 888 nt9.67□□□□□ -0.86
SLX1P38324 ERG6YML008C 1152 nt9.67□□□□□ -0.86
SLX1P38324 SAM3YPL274W 1764 nt9.65□□□□□ -0.87
SLX1P38324 TUB4YLR212C 1422 nt9.65□□□□□ -0.87
SLX1P38324 BNI5YNL166C 1347 nt9.64□□□□□ -0.87
SLX1P38324 SOD2YHR008C 702 nt9.64□□□□□ -0.87
SLX1P38324 GND2YGR256W 1479 nt9.64□□□□□ -0.87
SLX1P38324 POT1YIL160C 1254 nt9.63□□□□□ -0.87
SLX1P38324 HIF1YLL022C 1158 nt9.63□□□□□ -0.87
SLX1P38324 ESBP6YNL125C 2022 nt9.63□□□□□ -0.87
SLX1P38324 GSF2YML048W 1212 nt9.62□□□□□ -0.87
SLX1P38324 MHF1YOL086W-A 273 nt9.62□□□□□ -0.87
SLX1P38324 YIA6YIL006W 1122 nt9.61□□□□□ -0.87
SLX1P38324 PHO23YNL097C 993 nt9.6□□□□□ -0.87
SLX1P38324 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.59□□□□□ -0.87
SLX1P38324 APS2YJR058C 444 nt9.58□□□□□ -0.88
SLX1P38324 TPS1YBR126C 1488 nt9.58□□□□□ -0.88
SLX1P38324 MSC1YML128C 1542 nt9.57□□□□□ -0.88
SLX1P38324 CTI6YPL181W 1521 nt9.57□□□□□ -0.88
SLX1P38324 YPR126CYPR126C 309 nt9.57□□□□□ -0.88
SLX1P38324 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.57□□□□□ -0.88
SLX1P38324 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.57□□□□□ -0.88
SLX1P38324 SPT20YOL148C 1815 nt9.56□□□□□ -0.88
SLX1P38324 SAM2YDR502C 1155 nt9.54□□□□□ -0.88
SLX1P38324 RAS2YNL098C 969 nt9.54□□□□□ -0.88
SLX1P38324 IML3YBR107C 738 nt9.54□□□□□ -0.88
SLX1P38324 SEC61YLR378C 1443 nt9.53□□□□□ -0.88
SLX1P38324 SHY1YGR112W 1170 nt9.52□□□□□ -0.89
SLX1P38324 OYE2YHR179W 1203 nt9.52□□□□□ -0.89
SLX1P38324 ILV2YMR108W 2064 nt9.51□□□□□ -0.89
SLX1P38324 DAK2YFL053W 1776 nt9.51□□□□□ -0.89
SLX1P38324 NIF3YGL221C 867 nt9.51□□□□□ -0.89
SLX1P38324 UFO1YML088W 2007 nt9.51□□□□□ -0.89
SLX1P38324 YNL024CYNL024C 741 nt9.49□□□□□ -0.89
SLX1P38324 YCP4YCR004C 744 nt9.48□□□□□ -0.89
SLX1P38324 FUB1YCR076C 753 nt9.48□□□□□ -0.89
SLX1P38324 OXA1YER154W 1209 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX1P38324 YER188WYER188W 720 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX1P38324 SAM50YNL026W 1455 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX1P38324 INA1YLR413W 2028 nt9.46□□□□□ -0.89
SLX1P38324 DTR1YBR180W 1719 nt9.46□□□□□ -0.89
SLX1P38324 IGD1YFR017C 588 nt9.46□□□□□ -0.9
SLX1P38324 OYE3YPL171C 1203 nt9.46□□□□□ -0.9
SLX1P38324 EAF3YPR023C 1206 nt9.46□□□□□ -0.9
SLX1P38324 POP2YNR052C 1302 nt9.44□□□□□ -0.9
SLX1P38324 URA6YKL024C 615 nt9.43□□□□□ -0.9
SLX1P38324 QDR2YIL121W 1629 nt9.42□□□□□ -0.9
SLX1P38324 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.42□□□□□ -0.9
SLX1P38324 TMA23YMR269W 636 nt9.42□□□□□ -0.9
SLX1P38324 RPC82YPR190C 1965 nt9.41□□□□□ -0.9
SLX1P38324 PET8YNL003C 855 nt9.41□□□□□ -0.9
SLX1P38324 YCR025CYCR025C 411 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX1P38324 RIM8YGL045W 1629 nt9.39□□□□□ -0.91
SLX1P38324 DDI1YER143W 1287 nt9.39□□□□□ -0.91
SLX1P38324 ACO2YJL200C 2370 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX1P38324 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms