Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCAP37840 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCAP37840 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCAP37840 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCAP37840 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCAP37840 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNCAP37840 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCAP37840 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCAP37840 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCAP37840 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCAP37840 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCAP37840 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCAP37840 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCAP37840 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCAP37840 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNCAP37840 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCAP37840 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCAP37840 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNCAP37840 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNCAP37840 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCAP37840 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNCAP37840 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNCAP37840 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCAP37840 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCAP37840 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNCAP37840 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCAP37840 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNCAP37840 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNCAP37840 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNCAP37840 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCAP37840 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCAP37840 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCAP37840 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNCAP37840 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNCAP37840 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNCAP37840 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCAP37840 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCAP37840 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCAP37840 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCAP37840 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCAP37840 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNCAP37840 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCAP37840 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNCAP37840 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNCAP37840 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCAP37840 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCAP37840 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCAP37840 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNCAP37840 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCAP37840 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCAP37840 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCAP37840 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCAP37840 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCAP37840 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCAP37840 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCAP37840 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCAP37840 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCAP37840 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCAP37840 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCAP37840 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCAP37840 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCAP37840 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCAP37840 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCAP37840 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCAP37840 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCAP37840 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCAP37840 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCAP37840 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCAP37840 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCAP37840 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCAP37840 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCAP37840 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCAP37840 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCAP37840 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCAP37840 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCAP37840 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCAP37840 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCAP37840 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCAP37840 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCAP37840 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCAP37840 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCAP37840 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCAP37840 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNCAP37840 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCAP37840 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCAP37840 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNCAP37840 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCAP37840 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCAP37840 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCAP37840 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCAP37840 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNCAP37840 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms