Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD12P35452 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD12P35452 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXD12P35452 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD12P35452 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD12P35452 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms