Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDC2P34741 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDC2P34741 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDC2P34741 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDC2P34741 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDC2P34741 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDC2P34741 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDC2P34741 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDC2P34741 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDC2P34741 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDC2P34741 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDC2P34741 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDC2P34741 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDC2P34741 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDC2P34741 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDC2P34741 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDC2P34741 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDC2P34741 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDC2P34741 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDC2P34741 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDC2P34741 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDC2P34741 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDC2P34741 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDC2P34741 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDC2P34741 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDC2P34741 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDC2P34741 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDC2P34741 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDC2P34741 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDC2P34741 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDC2P34741 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDC2P34741 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDC2P34741 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDC2P34741 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDC2P34741 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDC2P34741 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDC2P34741 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDC2P34741 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDC2P34741 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDC2P34741 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDC2P34741 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDC2P34741 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDC2P34741 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDC2P34741 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDC2P34741 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDC2P34741 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDC2P34741 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDC2P34741 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDC2P34741 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDC2P34741 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDC2P34741 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDC2P34741 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDC2P34741 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDC2P34741 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDC2P34741 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDC2P34741 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDC2P34741 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDC2P34741 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDC2P34741 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SDC2P34741 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SDC2P34741 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDC2P34741 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDC2P34741 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDC2P34741 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDC2P34741 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDC2P34741 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDC2P34741 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDC2P34741 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDC2P34741 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDC2P34741 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDC2P34741 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDC2P34741 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDC2P34741 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDC2P34741 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDC2P34741 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDC2P34741 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDC2P34741 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDC2P34741 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDC2P34741 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDC2P34741 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SDC2P34741 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDC2P34741 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDC2P34741 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDC2P34741 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDC2P34741 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDC2P34741 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDC2P34741 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDC2P34741 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDC2P34741 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDC2P34741 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDC2P34741 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDC2P34741 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDC2P34741 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDC2P34741 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDC2P34741 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDC2P34741 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDC2P34741 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDC2P34741 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDC2P34741 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDC2P34741 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms