Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CPS1P31327 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CPS1P31327 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CPS1P31327 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CPS1P31327 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CPS1P31327 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CPS1P31327 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CPS1P31327 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
CPS1P31327 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CPS1P31327 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CPS1P31327 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CPS1P31327 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CPS1P31327 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CPS1P31327 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CPS1P31327 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CPS1P31327 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CPS1P31327 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CPS1P31327 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CPS1P31327 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CPS1P31327 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CPS1P31327 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CPS1P31327 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CPS1P31327 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CPS1P31327 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CPS1P31327 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CPS1P31327 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CPS1P31327 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CPS1P31327 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CPS1P31327 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CPS1P31327 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CPS1P31327 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CPS1P31327 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CPS1P31327 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CPS1P31327 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CPS1P31327 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CPS1P31327 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CPS1P31327 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CPS1P31327 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CPS1P31327 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CPS1P31327 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CPS1P31327 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CPS1P31327 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CPS1P31327 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CPS1P31327 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CPS1P31327 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CPS1P31327 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CPS1P31327 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CPS1P31327 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CPS1P31327 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CPS1P31327 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CPS1P31327 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CPS1P31327 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CPS1P31327 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CPS1P31327 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CPS1P31327 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CPS1P31327 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CPS1P31327 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CPS1P31327 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CPS1P31327 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CPS1P31327 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CPS1P31327 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CPS1P31327 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPS1P31327 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPS1P31327 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPS1P31327 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPS1P31327 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPS1P31327 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CPS1P31327 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CPS1P31327 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CPS1P31327 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CPS1P31327 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CPS1P31327 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CPS1P31327 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CPS1P31327 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CPS1P31327 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CPS1P31327 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CPS1P31327 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CPS1P31327 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CPS1P31327 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CPS1P31327 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CPS1P31327 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CPS1P31327 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms