Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCSK6P29122 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCSK6P29122 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCSK6P29122 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCSK6P29122 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCSK6P29122 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCSK6P29122 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms