Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJB2P29033 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJB2P29033 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJB2P29033 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJB2P29033 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJB2P29033 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB2P29033 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB2P29033 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB2P29033 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB2P29033 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB2P29033 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB2P29033 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB2P29033 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB2P29033 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB2P29033 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJB2P29033 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJB2P29033 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB2P29033 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB2P29033 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB2P29033 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB2P29033 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB2P29033 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB2P29033 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB2P29033 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB2P29033 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB2P29033 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB2P29033 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB2P29033 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJB2P29033 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB2P29033 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB2P29033 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJB2P29033 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJB2P29033 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJB2P29033 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJB2P29033 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJB2P29033 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJB2P29033 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB2P29033 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJB2P29033 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB2P29033 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJB2P29033 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJB2P29033 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB2P29033 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB2P29033 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB2P29033 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB2P29033 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB2P29033 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJB2P29033 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJB2P29033 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJB2P29033 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJB2P29033 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJB2P29033 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJB2P29033 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJB2P29033 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJB2P29033 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJB2P29033 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJB2P29033 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJB2P29033 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJB2P29033 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB2P29033 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB2P29033 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJB2P29033 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJB2P29033 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJB2P29033 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJB2P29033 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJB2P29033 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB2P29033 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB2P29033 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB2P29033 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB2P29033 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJB2P29033 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJB2P29033 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJB2P29033 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB2P29033 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB2P29033 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB2P29033 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJB2P29033 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJB2P29033 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GJB2P29033 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB2P29033 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJB2P29033 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJB2P29033 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GJB2P29033 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJB2P29033 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJB2P29033 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJB2P29033 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB2P29033 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB2P29033 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB2P29033 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJB2P29033 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJB2P29033 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJB2P29033 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB2P29033 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB2P29033 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB2P29033 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB2P29033 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB2P29033 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB2P29033 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB2P29033 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GJB2P29033 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms