Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTR1BP28222 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTR1BP28222 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR1BP28222 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HTR1BP28222 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR1BP28222 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HTR1BP28222 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HTR1BP28222 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms