Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRM1P23921 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RRM1P23921 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRM1P23921 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRM1P23921 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRM1P23921 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRM1P23921 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRM1P23921 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRM1P23921 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRM1P23921 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRM1P23921 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRM1P23921 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRM1P23921 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRM1P23921 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRM1P23921 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRM1P23921 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRM1P23921 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRM1P23921 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRM1P23921 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRM1P23921 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRM1P23921 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRM1P23921 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRM1P23921 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRM1P23921 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRM1P23921 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRM1P23921 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRM1P23921 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RRM1P23921 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRM1P23921 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRM1P23921 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRM1P23921 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRM1P23921 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRM1P23921 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRM1P23921 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRM1P23921 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RRM1P23921 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRM1P23921 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRM1P23921 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRM1P23921 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRM1P23921 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRM1P23921 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRM1P23921 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRM1P23921 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRM1P23921 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRM1P23921 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRM1P23921 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RRM1P23921 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRM1P23921 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRM1P23921 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRM1P23921 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRM1P23921 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRM1P23921 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRM1P23921 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRM1P23921 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRM1P23921 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRM1P23921 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRM1P23921 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRM1P23921 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRM1P23921 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRM1P23921 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RRM1P23921 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRM1P23921 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRM1P23921 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRM1P23921 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRM1P23921 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRM1P23921 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRM1P23921 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRM1P23921 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRM1P23921 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRM1P23921 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRM1P23921 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRM1P23921 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRM1P23921 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRM1P23921 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRM1P23921 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRM1P23921 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRM1P23921 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRM1P23921 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRM1P23921 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRM1P23921 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRM1P23921 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRM1P23921 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRM1P23921 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRM1P23921 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRM1P23921 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRM1P23921 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRM1P23921 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRM1P23921 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRM1P23921 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRM1P23921 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRM1P23921 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRM1P23921 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRM1P23921 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRM1P23921 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms