Protein–RNA interactions for Protein: P22681

CBL, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLP22681 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBLP22681 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBLP22681 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBLP22681 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBLP22681 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBLP22681 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBLP22681 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBLP22681 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBLP22681 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBLP22681 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLP22681 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLP22681 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLP22681 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLP22681 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLP22681 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLP22681 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLP22681 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLP22681 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLP22681 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLP22681 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLP22681 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLP22681 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBLP22681 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBLP22681 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBLP22681 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBLP22681 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLP22681 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLP22681 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLP22681 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLP22681 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLP22681 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLP22681 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CBLP22681 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBLP22681 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBLP22681 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBLP22681 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLP22681 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLP22681 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBLP22681 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBLP22681 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CBLP22681 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBLP22681 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLP22681 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLP22681 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLP22681 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLP22681 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLP22681 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLP22681 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLP22681 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLP22681 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLP22681 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLP22681 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLP22681 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLP22681 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLP22681 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLP22681 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLP22681 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBLP22681 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBLP22681 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLP22681 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLP22681 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLP22681 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBLP22681 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLP22681 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLP22681 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLP22681 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLP22681 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLP22681 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLP22681 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBLP22681 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBLP22681 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBLP22681 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBLP22681 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBLP22681 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CBLP22681 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLP22681 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLP22681 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLP22681 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLP22681 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBLP22681 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBLP22681 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLP22681 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLP22681 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLP22681 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLP22681 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLP22681 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLP22681 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBLP22681 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBLP22681 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLP22681 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLP22681 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLP22681 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLP22681 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBLP22681 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms